Áreas de conocimiento: Química Física.
Director: Pedro Luis Mateo Alarcón.
Secretario: Enrique López-Cantarero Vargas.
Profesorado: CU: 4/ PTU: 9
Grupos de investigación:
- Biomoléculas. Director: José Manuel Sánchez Ruiz
- Biofísica y Biotecnología Molcular. Director: Pedro Luis Mateo Alarcón
- Química Física Biomolecular .Director: Antonio Parody Morreale
Proyectos de investigación:
- EuroNeut-41. European Consortium on Neutralizing antibodies using gp41. HEALTH-F3-2007-201038. Investigador Principal: Pedro Luis Mateo Alarcón.
- Structure, thermodynamics, dynamics and citotoxicity of amyloid fibril precursors of the SH3 domain. Investigador Principal: Francisco Conejero Lara.
- Structural and thrermodynamic analysis of SH3 domains of CD2AP and their interactions with natural targets key for renal function. Investigador Principal: Nico A.J. van Nuland.
- Aplicación de métodos rápidos en Resonancia Magnética Nuclear biomolecular al estudio de módulos proteicos de reconocimiento molecular. Investigador Principal: Nico A.J. van Nuland.
- Bases moleculares de la afinidad y especificidad de unión en módulos de reconocimiento de secuencias ricas en prolina. Diseño y desarrollo de inhibidores de interés biotecnológico. Investigador Principal: Irene Luque Fernández.
- Construcción de un calorímetro de máxima sensibilidad. investigación de la afinidad por heparina de factores de crecimiento (FGF1 Y FGF2). Aplicación en tecnologías de cribado masivo. Investigador Principal: Antonio Parody Morreale
- Diseño y obtención de protoenzimas artificiales: Aplicaciones en Catálisis enzimática y terapia molecular. Investigador Principal: Beatriz Ibarra Molero.
- Diseño de proteínas con barreras de plegamiento marginales: ¿Una nueva ruta hacia proteínas terapéuticas? Investigador Principal: José Manuel Sánchez Ruiz.
- Ingeniería de Proteínas. Investigador Principal: José Manuel Sánchez Ruiz.
- Estados alternativos nativos o cuasi-nativos de proteínas: Implicaciones biotecnológicas biomédicas. Investigador Principal: José Manuel Sánchez Ruiz.
- Diseño molecular de una proteína con actividad antitumoral. Investigador Principal: Mª del Mar García Mira.
Tesis doctorales leídas: 2.
Másteres y doctorados en los que participa:
- Química.
- Biotecnología
Titulaciones en las que el departamento imparte docencia:
-Licenciado en Química
-Licenciado en Ciencias Ambientales
-Licenciado en Bioquímica
-Ingeniero Químico
Contratos de investigación
- Estudios de antioxidantes naturales presentes en el aceite de oliva, evaluación del estado oxidativo y determinación del contenido en ácidos grasos.
Entidades participantes:
Responsable: Fernando Martínez Martínez
Tesis leídas
- Diseño y caracterización de proteínas quiméricas para el estudio del reconocimiento molecular entre ligandos peptídicos y dominios SH3
Doctorando: Adela María Candel Ramón
Director: Francisco Conejero Lara, José Cristóbal Martínez Herrerías
Fecha de lectura: 22/02/2008
- Reconocimiento de secuencias ricas en prolina por dominios modulares de nteracción proteína-proteína
Doctorando: Andrés Palencia Carrilero
Director: Irene Luque Fernández y José Cristóbal Martínez Herrerías
Fecha de lectura: 06/06/2008
Participación en Congresos
- 235th ACS National Meeting.
Lugar y fecha: New Orleans, LA, United States, April 6-10, (2008).
Nombre de la ponencia: Three component, highly diastereoselective metal free synthesis of 2,3,4,5 tetrasubstituted pyrrolidines. Abstracts of Papers.
Ponentes: Crovetto, Luis; Rios, Ramon.
- 235th ACS National Meeting.
Lugar y fecha: : New Orleans, LA, United States, April 6-10, (2008).
Nombre de la ponencia: Photophysics of a xanthenic derivative dye useful as “on/off” fluorescence probe. Abstracts of Papers.
Ponentes: Crovetto, Luis; Paredes, Jose M.; Rios, Ramon; Lozano-Velez, Patricia; Talavera, Eva M.; Alvarez-Pez, Jose M.
- FEBS Workshop: the biology of modular protein domains
Lugar y fecha: Seefeld (Austria), 08/09/2007
Nombre de la ponencia o comunicación: Thermodynamic analysis of the conformational equilibrium of Nedd4-WW4 domain
Ponente: Iglesias-Bexiga, M., Cobos, E.S., Luque, I., Martínez, J.C.
- FEBS Workshop: the biology of modular protein domains
Lugar y fecha: Seefeld (Austria), 08/09/2007
Nombre de la ponencia o comunicación: Complexity in ligand recognition by proline-rich interaction domains
Ponente: Palencia, A., Martín-García, J.M., Ruiz-Sanz, J., Martínez, J.C., Luque, I.
- FEBS Workshop: the biology of modular protein domains
Lugar y fecha: Seefeld (Austria), 08/09/2007
Nombre de la ponencia o comunicación: A crystallographic study of the Abl-SH3 domain: effect of single mutations on the cristal quality
Ponente: Palencia, A., Martínez, J.C., Gavira, J.A., Mateo, P.L., Luque, I., Cámara-Artigas, A.M.
Profesores visitantes:
- Enrique Arnaldo San Román.
Centro de origen: Departamento de Química Inorgánica, Analítica y Química Física de la Universidad de Buenos Aires.
Fechas de estancia: Del 13 al 23 de Septiembre de 2007.
Artículos publicados en revistas nacionales
- Estudio cinético de la fotodegradación del ion p-hidroxibencenodiazonio en medio polar.
Autor: Quintero, B.; Cabeza, M.C..; Martinez Puentedura, M.I..; Martinez de las Parras, P.J.; Gutierrez, M.P.
Nombre de la revista: Ars Pharm
Datos de publicación (nº, fecha, páginas): 48. 2007. 297-310. España.
Artículos publicados en revistas internacionales
- Single-molecule analysis of human telomerase monomer
Autor: D. Alves, H. Li, R. Codrington, A. Orte, X. Ren, D. Klenerman and S. Balasubramanian
Nombre de la revista: Nature Chem. Biol
Datos de publicación (nº, fecha, páginas): 2008, 82, 2367-2369
- Photophysics of a Xanthenic Derivative Dye Useful as “On/Off” Fluorescence Probe.
Autor: L. Crovetto, J. M. Paredes; R. Rios; E. M. Talavera, J. M. Alvarez-Pez
Nombre de la revista: J. Phys. Chem. A
Datos de publicación (nº, fecha, páginas): 2007, 111, 13311-13320
- “Experimental data on chronic magnesium deficiency”
Autor: Aranda, P.; Planells, E.; Sanchez, C.; Quintero, B.; Llopis, J
Nombre de la revista: Springer-Verlag “New perspectives in magnesium research”. Yoshiki Nishizawa, Hirotoshi Morii and Jean Durlach Editores.
Datos de publicación (nº, fecha, páginas): 2007. 104-116. London. UK.
- Engineering proteins with tunable thermodynamic and kinetic stabilities.
Autor: Pey AL, rodriguez-Larrea D, Bomke S, Dammers S, Godoy-Ruiz R, Garcia-Mira MM, Sanchez Ruiz JM.
Nombre de la revista: Proteins
Datos de publicación (nº, fecha, páginas): 71(1), Apr 2008, 165-74
- Molecular Basis of Histone H3K4ME3 Recognition by ING4
Autor: Alicia Palacios, Inés G. Muñoz, David Pantoja-Uceda, María J. Marcaida, Daniel Torres, José M. Martín-García, Irene Luque, Guillermo Montoya and Francisco J. Blanco
Nombre de la revista: Journal of Biological Chemistry
Datos de publicación (nº, fecha, páginas): 283, 6 Junio 2008, 15956-15964
- Crystallographic Structure of the SH3 Domain of the Human c-Yes Tyrosine Kinase: Loop Flexibility and Amyloid Aggregation
Autor: A. Camara-Artigas, I. Luque, J.M. Martin-Garcia, P.L. Mateo, J. Ruiz-Sanz
Nombre de la revista: FEBS Letters
Datos de publicación (nº, fecha, páginas): 581, 2007, 1701-1706
- Structural and Thermodynamic studies of Bergerac-SH3 chimeras.
Autor: ): L.V.Guschina, A. Gabdulkhakov, S. Nikonov, P.L. Mateo, V.V. Filimonov
Nombre de la revista: FEBS Journal
Datos de publicación (nº, fecha, páginas): (enviado), 2008
- The high-resolution NMR structure of a single-chain chimeric protein mimicking a SH3-peptide complex
Autor: Candel, A.M., Conejero-Lara, F., Martínez, J.C., van Nuland, N.A.J., Bruix, M.
Nombre de la revista: FEBS Letters
Datos de publicación (nº, fecha, páginas): 581, 2007, 687-692
- Crystallization by capillary counter-diffusion and structure determination of the N114A mutant of the SH3 domain of Abl tyrosine kinase complexed with a high-affinity peptide ligand
Autor: Cámara-Artigas, A., Palencia, A., Martínez, J.C., Luque, I., Gavira, J.A., García-Ruiz, J.M.
Nombre de la revista: Acta Crystallographica D
Datos de publicación (nº, fecha, páginas): 63, 2007, 646-652
- Analysis of the thermodynamics of binding of an SH3 domain to proline-rich peptides using a chimeric fusion protein
Autor: Candel, A.M., van Nuland, N.A.J., Martín-Sierra, F.M., Martínez, J.C., Conejero-Lara, F.
Nombre de la revista: Journal of Molecular Biology
Datos de publicación (nº, fecha, páginas): 377, 2008, 117-135
- An error analysis for two-state protein-folding kinetic parameters and?-values: progress towards precision by exploing pH dependencies on Leffler plots
Autor: Cobos, E.S., Candel, A.M., Martínez, J.C.
Nombre de la revista: Biophysical Journal
Datos de publicación (nº, fecha, páginas): 94, 2008, 4393-4404
- Beyond Lumry-Eyring: an unexpected pattern of operational reversilibity/irreversibility in protein denaturation
Autor: David Rodríguez-Larrea, Beatriz Ibarra-Molero, L. de Maria, TV Borchert and Jose M. Sanchez-Ruiz
Nombre de la revista: Proteins
Datos de publicación (nº, fecha, páginas): 70, 2008, 19-24
- Large-scale modulation of thermodynamic protein folding barriers linked to electrostatics
Autor: O Halskau, Raul Perez-Jimenez, Beatriz Ibarra-Molero, J Underhaug, Victor Muñoz, Aurora Martinez and Jose M. Sanchez-Ruiz
Nombre de la revista: Proceedings of the Nacional Academy of Sciences of USA
Datos de publicación (nº, fecha, páginas): (in press)
Otras actividades:
-Angel Orte Martínez. Department of Chemistry. Lensfield Road. Cambridge. UK. Enero 2005. continúa.
-Luis Crovetto González. Leuven (Bélgica) . Agosto 2007.